Il s'accouple dans l'eau juste avant la saison des pluies. Sa période de gestation est d'environ 150 jours. Il naît 2 à 8 petits par portée, qui sont sevrés au bout de 16 semaines. A 18 mois, l'âge adulte est atteint et le jeune Capybara est à son tour en âge de se reproduire. Sa longévité, qui à l'origine était de 12 ans, se voit considérablement réduite du fait de la chasse.