On peut retrouver la tortue serpentine dans différents types d’habitats. Elle peut fréquenter certains milieux humides tels que les étangs et les marais, mais peut également être aperçue dans nos lacs et nos rivières. Malgré sa capacité à coloniser presque tous les milieux d’eau douce, elle préfèrera les milieux humides ou les milieux aquatiques à faible courant, au fond vaseux et à la végétation dense.